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タグ: Cytoscape

CytoScapeRPCでXGMMLファイル出力

2011年8月19日 2013年9月26日Programming Cytoscape, Java, PHP 2

CytoScapeRPC から直接は GML ファイルしか出力できなかった。 他の機能でできないか調査。 executeCommand() という機能があるが、使える機能なのかさっぱりわからない。 なので、CytoSca…

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CytoScapeRPC で GML ファイル出力

2011年8月17日 2013年9月26日Programming Cytoscape, PHP 0

以前、PHP で CytoScape を操って png を出力するネタを書きましたが、その続き。 「CytoScape を PHP で操りファイルを出力して、CytoScapeWeb に読み込ませる」 という計画を立てた…

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CytoScape でPDFにエクスポートすると日本語が消える

2011年6月30日 2013年9月26日Linux Cytoscape 0

CytoScape で描いたグラフをPDFにエクスポートすると日本語が消える。 pdf を軽くするために、システムフォントを使うをチェックしてエクスポートすると消える。 この問題は Linux で使う場合だけかもしれない…

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CytoscapeをPHPで動かす

2010年12月10日 2013年9月26日Programming Cytoscape, PHP 0

perl から Cytoscape を扱えることはperlからCytoscapeを利用し、jpegに保存の通りできることがわかった しかし、使う言語ってphpかCのどちらかなんですよね 皆さんはどうでしょう? 今回は p…

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perlからCytoscapeを利用し、jpegに保存

2010年11月30日 2013年9月26日Analysis, Programming Cytoscape, perl 0

PerlからCytoscapeを利用する というブログを発見! 以前から Cytoscapeは使わせて頂いたのだけど、 「ライブラリみたいに利用出来ればなぁ」 と思っていた。まさにこれ使えそう(^^) Perlから利用出…

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